La ZNIEFF « Vallée de la Mosson de Grabels à Saint-Jean-de-Védas » se situe dans le département de l'Héraut, en périphérie ouest de la ville de Montpellier. Elle correspond à l'étroite bande longeant la rivière de la Mosson dans son cours moyen ainsi que quelques affluents temporaires en amont. Elle couvre une superficie de près de 115 hectares pour une altitude comprise entre 15 et 130 mètres.
La ZNIEFF est limitée à l'amont (Grabels) par la source de Labit et à l'aval par le pont de la route N113 (au niveau de Saint-Jean-de-Védas). De part et d'autre de la rivière, le périmètre concerne tous les espaces liés directement à la rivière, souvent jusqu'aux limites du territoire urbanisé.