La ZNIEFF « Ravin des Mouchouses » est située dans le massif des Albères, au sud-est du département des Pyrénées-Orientales, à la frontière avec l'Espagne. Elle englobe le bassin versant du ruisseau du Taillat d'en Bac en amont des hameaux de la Farga et de la Vallée Heureuse jusqu'au col des Emigrants. Le territoire défini occupe une superficie d'environ 485 hectares pour une altitude variant entre 260 et 1175 mètres.
Le périmètre de la ZNIEFF est essentiellement matérialisé par des lignes de crêtes :
- au sud, entre le Pic de Pradets et le point coté 1158 mètres ;
- à l'est, le long de la ZNIEFF voisine « Ravin de la Massane », puis vers le Colladas de l'Espinas ;
- à l'ouest, en passant par les points cotés 1085, 1052, 856 et 580 mètres.
A l'ouest, la délimitation longe également un petit linéaire de ruisseau jusqu'au Colladas de l'Espinas.