La ZNIEFF de l'Ile de Sainte-Lucie se situe sur le littoral audois, au nord de Port-la-Nouvelle. Au sein du complexe lagunaire des étangs du Narbonnais, cette île de 304 hectares est bordée par les Salins de Sainte-Lucie, les étangs de l'Ayrolle et de Bages-Sigean.
La position de l'île, sa topographie et son altitude expliquent la diversité des faciès de végétation que l'on y rencontre : des milieux secs composés essentiellement de bois au centre de l'île et des milieux humides et halophiles (salés) sur ses marges.
Peu d'activités humaines s'y déroulent. Elle est toutefois assez fréquentée par les touristes, en particulier lors de la saison estivale.
La ZNIEFF englobe l'Ile et ses bordures comme au niveau de l'île de la Nadière, mais elle n'inclut pas l'étang du Charlot.