La ZNIEFF « Plateaux et vallées autour de Fontjoncouse » est située dans les Corbières orientales, au sud-est du département de l'Aude. Elle englobe plusieurs vallons, plateaux et collines autour du village de Fontjoncouse. Le territoire défini occupe une superficie d'un peu plus de 1600 hectares pour une altitude comprise entre 200 et 420 mètres.
Le périmètre de la ZNIEFF s'appuie :
- au nord, sur des chemins, thalwegs et la route D323 ;
- à l'ouest, sur des thalwegs et la route D106 ;
- au sud, sur une succession de routes (D106 et 123), de thalwegs, de chemins et de points cotés ;
- à l'est, sur la limite des barres rocheuses de la crête de la Cadorque.
Le village de Fontjoncouse est exclu du périmètre.