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La ZNIEFF du Puig de l'Aliga se situe dans la plaine du Roussillon, à trois kilomètres au nord-ouest de Perpignan. Elle occupe une surface de 111 hectares entre le village de Peyrestortes au nord et la ZNIEFF de la mare de Peyrestortes au sud.
La zone correspond à une transition entre des hautes terrasses au sud et des basses terrasses au nord (terrasses de l'Agly). Le coteau marque la transition entre ces deux terrasses. Le coteau, exposé au nord, est majoritairement composé de bois, de fragments de pelouses sèches et de friches. Il tranche singulièrement avec l'environnement immédiat (basse et haute terrasses) principalement occupé par le vignoble.
Quelques sentiers agricoles et de randonnée parcourent le site. L'aéroport de Perpignan-Rivesaltes se trouve à moins de 100 m de cette ZNIEFF.
Les tracés nord et ouest montrent une bonne adéquation entre les limites topographiques, physiques (cours d'eau notamment) et le passage à des parcelles de vignoble. A l'est, ce sont les routes départementales D5f puis D5 qui marquent la limite. Au sud, le périmètre suit les sentiers jusqu'au lieu-dit « Coma de la Baneci « avant de rejoindre le cours d'eau « dels Oms «.
