La ZNIEFF « Moulin de Piquemole » est située à l'ouest du département lozérien, au sud du plateau de l'Aubrac. Elle s'étend sur un linéaire d'environ 900 mètres du ruisseau du Doulou (affluent du Lot) et du ruisseau de l'Hermet qui confluent en amont du Moulin de Piquemole. Elle occupe une superficie de 8,4 hectares de part et d'autre du Moulin, au pied du village de Trélans au nord-ouest de St Germain-du-Teil. L'altitude varie peu, autour de 850 mètres.
La ZNIEFF est délimitée en amont et en aval du Doulou par la lisière de la clairière forestière. Elle comprend environ 260 mètres de linéaire de l'Hermet en amont de leur confluence.
En rive gauche, le périmètre est marqué par le sentier et la limite communale et en rive droite par la lisière forestière et la piste forestière.