La ZNIEFF « Vallon du ruisseau de Maubert » est située au nord du département du Gard, à la frontière avec celui de l'Ardèche, au nord de la ville de Bessèges. Elle englobe la vallée du ruisseau de Maubert et ses principaux affluents. Elle couvre une superficie de 32 hectares sur le territoire de la commune de Bordezac. Son altitude varie entre 200 et 250 mètres.
Au nord-ouest, le périmètre s'appuie sur la limite régionale.
Au sud-est, le périmètre est matérialisé, de l'aval du ruisseau de Prat Peillard jusqu'à la confluence du ruisseau Maubert avec la Gagnière, par la courbe de niveau des 250 mètres de manière à englober les différents vallons adjacents.