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La ZNIEFF de la « Vallée de la Lergue » est située au coeur du département de l'Hérault immédiatement au nord et à l'est du lac du Salagou. Elle est constituée d'un linéaire de près de 16 kilomètres de la rivière de la Lergue ainsi que de l'aval de l'un de ses affluents (la Marguerite). Cet ensemble couvre une surface d'environ 255 hectares, pour une altitude variant entre 25 et 100 mètres.
Le périmètre de la ZNIEFF comprend le lit mineur de la Lergue et ses zones humides riveraines (bras morts et ripisylves), entre le Champs Rodiez (à l'aval du hameau de Cartels en bordure de l'autoroute A75) et la confluence avec l'Hérault.
La partie aval de la Marguerite (cours d'eau, bras mort et ripisylve) sont également inclus dans la ZNIEFF du pont de chemin de fer à sa confluence avec la Lergue.
