La ZNIEFF « Gorges de la Cèze amont » est située au nord du département du Gard et au sud de la commune de Barjac. Elle englobe, sur un linéaire d'un peu plus de 5 kilomètres, la vallée de la Cèze à l'aval du village de Tharaux. La rivière traverse ici un plateau calcaire qu'elle a entaillé sur près de 200 mètres d'épaisseur, et est à l'origine d'une gorge relativement étroite et encaissée. Le territoire défini occupe une surface totale de près de 490 hectares, pour une altitude variant entre 90 et 300 mètres.
Le périmètre de la ZNIEFF est délimité :
- au nord, par des chemins et des pistes sur les pentes de la Serre de Barri, de la Serre de Combe Longue et des Travers, puis par la rive gauche de la rivière entre les camps de la Sablière et de la Genèse ;
- à l'ouest, par une piste le long du ruisseau de Malaygue, et la rive gauche de la Cèze ;
- au sud et au sud-est par différentes pistes et routes entre les Baux et le camp de la Genèse.