La ZNIEFF « Bois des Mousques » est située au nord-ouest du département de l'Aude et au nord de la ville de Castelnaudary, dans les contreforts occidentaux de la Montagne Noire. Elle englobe environ 130 hectares de bois et de zones agricoles au niveau des hameaux des Mousques Hautes et Basses à l'ouest du village de Labécède-Lauragais. L'altitude varie de 200 à 310 mètres.
Le périmètre de la ZNIEFF est matérialisé :
- au nord, par la route D334 et un thalweg ;
- à l'ouest, par la limite communale (en partie longée par un chemin) ;
- au sud, par des limites de parcelles marquant plus ou moins la lisière forestière ;
- à l'est, par le ruisseau de Glande.