La ZNIEFF « Fossés humides de Vaujus » est située à l'est du département du Gard, à la périphérie sud-est de la ville de Rochefort-du-Gard. Elle englobe quelques parcelles cultivées ou en friche autour de deux fossés humides. Le territoire défini occupe une superficie de 13 hectares entre le Mas du Petit Vigneret et le lotissement de Vaujus. L'altitude varie peu, autour de 150 mètres.
Le périmètre de la ZNIEFF est matérialisé par des limites de parcelles.