La ZNIEFF « Grotte de Calmeilles » est située au coeur du département des Pyrénées-Orientales, dans le massif des Aspres, une région de piémont entre la plaine du Roussillon et le massif du Canigou. Elle est centrée sur le Correc de la Gorga et englobe les versants alentours. Le territoire défini occupe une superficie de près de 90 hectares entre le village de Calmeilles et le pied du sommet du Montner. L'altitude est comprise entre 350 et 650 mètres.
Le périmètre de la ZNIEFF est matérialisé :
- au nord, par des thalwegs (dont le Correc de la Dou) ;
- à l'ouest, par une piste forestière et la route D13 ;
- au sud, par la route D13 et des limites de parcelles de manière à exclure le village de Calmeilles ;
- à l'est, par un thalweg et une route forestière.