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La ZNIEFF s’étale le long du fleuve, depuis Aléria jusqu’au pont de Noceta. La basse vallée du Tavignano est le seul endroit de Corse où l'Alose feinte se reproduit actuellement ; le fleuve abrite en outre la blennie fluviatile et de nombreux invertébrés macrobenthiques déterminants. On trouve également le long de la vallée une des plus grosses colonies de Corse de Murins à Oreilles échancrées et plusieurs colonies importantes de Petit Rhinolophe. La présence de ces chauves-souris a par ailleurs justifié la mise en place d’un site Natura 2000 sur la zone. L'habitat prioritaire "sources pétrifiantes" est également présent ce qui confère au site un intérêt majeur. Tout le long du cours d'eau se trouve une ripisylve à Saule blanc et Peuplier blanc qui constitue l'habitat "Forêts-galeries à Salix alba et Populus alba". La zone est aussi utilisée par des reptiles et des amphibiens comme la Tortue Cistude et le Discoglosse sarde. La flore du site présente notamment une riche diversité d'orchidées. La création de cette ZNIEFF se justifie par la présence de nombreuses espèces et habitats déterminants, mais aussi pour la richesse écologique et la biodiversité de l'ensemble de la vallée du Tavignano.
La ZNIEFF englobe de pSIC FR 9400602 et propose des extensions suivant l'intérêt floristique 'orchidées) et faunistique (mammifères, poissons, reptiles et amphibiens, oiseaux) établi d'après la bibliographie et les contacts pris.
