Typologie nationale des biocénoses benthiques de Méditerranée (NatHab-Med)
Updated date of data set
08/11/2021
Authors of the typology
Noëmie MICHEZ (PatriNat), Annabelle AISH (PatriNat), Jean-Michel Amouroux, Gérard BELLAN (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Denise BELLAN-SANTINI (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Pierre CHEVALDONNE (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Guillaume DIRBERG (SPN, MNHN), Marie-Claire FABRI (IFREMER, LER), Thierry FERNEZ (Office de l’Environnement de la Corse), Maïa FOURT (GIS Posidonie), Patrice FRANCOUR (Université de Nice-Sophia Antipolis, EA 4228 ECOMERS), Guy-François FRISONI (Office de l’Environnement de la Corse), Adrien GOUJARD (GIS Posidonie), Jean-Georges HARMELIN (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294), Esther JORDANA (Centre d'Estudis Avançats de Blanes), Mario KLESCZEWSKI (Conservatoire d'Espaces Naturels, Languedoc-Roussillon), Céline LABRUNE (Observatoire Océanologique de Banyuls sur Mer, FRE 3350 LECOB), Jean-Baptiste MOURONVAL (Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage), Laura PALOMBA (SPN, MNHN), Thierry PEREZ (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Gérard PERGENT (Université de Corse Pasquale Paoli, UMR 6134 SPE), Christine PERGENT-MARTINI (Université de Corse Pasquale Paoli, UMR 6134 SPE), Stéphane SARTORETTO (IFREMER, LER), Thierry THIBAUT (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294), Jean VACELET (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Marc VERLAQUE (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294)
Authors of the table
Marie LA RIVIERE, Noëmie MICHEZ (PatriNat, OFB-CNRS-MNHN)
Territory concerned
Méditerranée française
Agency responsible
PatriNat, OFB-CNRS-MNHN, anciennement SPN
Original language Data
FR
Context
Compte tenu de l’intérêt grandissant des politiques publiques pour le milieu marin et de l’actualité chargée des différents programmes de gestion, de conservation ou d’inventaire (inventaires ZNIEFF, inventaire biologique et analyse écologique des habitats marins patrimoniaux, Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin, Système d’Information sur la Nature et le Paysage), le besoin de cohérence est élevé. Le développement de ces programmes nécessite la mise en place et l’utilisation d’outils tels que les référentiels. Ils permettent de définir un langage commun ainsi que les unités de travail. Parmi ces référentiels, il existe plusieurs classifications des habitats benthiques. Créées dans des contextes particuliers, elles répondent à des objectifs donnés, soit de connaissance et d’inventaire comme la typologie des ZNIEFF-Mer (Dauvin et al., 1994), soit de gestion et de conservation comme la typologie des habitats d’intérêt communautaire de l’Union Européenne (European Commission, 2007). Ces outils, adaptés à leur problématique, se rapportent à des échelles différentes : européenne pour Natura 2000 et EUNIS, nationale ou régionale pour les ZNIEFF. Il a donc paru nécessaire d’homogénéiser et d’harmoniser les référentiels existants.
Description of work
Ce travail a abouti à la création d’une liste de référence française des biocénoses, faciès et associations présents en Méditerranée. Elle a été élaborée en synthétisant et en actualisant les typologies existantes se rapportant aux habitats benthiques méditerranéens : la déclinaison française des habitats d’intérêt communautaire élaborée dans le cadre de Natura 2000 (Glémarec et Bellan-Santini in Bensettiti (coord.) et al., 2004), la classification des biocénoses benthiques marines de la région méditerranéenne élaborée dans le cadre de la Convention de Barcelone (PNUE, PAM, CAR/ASP, 2006 et 2007) ainsi que la liste des biocénoses de Méditerranée de l’inventaire ZNIEFF en PACA (Bellan-Santini et al., 2003). Ces classifications biocénotiques s’inscrivent dans la lignée des travaux de Pérès et Picard sur la définition des biocénoses benthiques de Méditerranée (Pérès et Picard, 1964). La typologie présentée dans ce travail ne comporte pas de changements majeurs. Les biocénoses décrites dans la littérature y ont été reportées et les principales modifications interviennent au niveau des faciès et des associations. Certains ont été supprimés, d’autres ont été ajoutés. Ils ont, pour la plupart, été conservés et peuvent avoir été regroupés, dissociés ou leur libellé a été modifié. Cette typologie est structurée en quatre niveaux. Le premier niveau correspond à l’étagement et le deuxième aux substrats et/ou le régime de salinité. Le troisième niveau fait apparaitre les biocénoses, le niveau quatre les faciès et associations de ces biocénoses. L’échelle de description de l’habitat (identifié par sa biocénose) correspond à l’échelle des habitats occupés par les macrophytes et la macrofaune benthiques. Les faciès et associations peuvent présenter un caractère saisonnier ou géographiquement localisé et ne constituent pas un niveau distinct mais un aspect particulier de la biocénose. Cette typologie de référence nationale peut être utilisée pour l’ensemble des programmes et outils qui concernent la façade méditerranéenne. Le niveau 3, celui de la biocénose, est généralement adapté aux problématiques de gestion et de conservation en permettant de nommer les habitats, notamment dans le cadre de travaux cartographiques. Le niveau des associations et des faciès est plus difficilement cartographiable à une certaine échelle (car nécessitant a priori des efforts d’échantillonnage élevés), mais reste néanmoins important pour la connaissance et leur prise en compte dans les études et inventaires. La première version de la typologie a été établie en 2011. Elle a été mise à jour en 2014 suite à de nouvelles acquisitions de connaissances. Un rapport détaillant les modifications effectuées entre ces deux versions (Michez et al., 2014) est disponible sur le site de l'INPN : http://spn.mnhn.fr/spn_rapports/archivage_rapports/2014/SPN%202014%20-%2033%20-%20Typologie_Mediterranee_version_2.pdf.
La description de chaque unité de niveaux 3 et 4 de cette typologie a été réalisée entre 2016 et 2021 (La Rivière et al., 2021). Au total le référentiel comporte 151 fiches descriptives pour les biocénoses, faciès et associations de la typologie (seul un faciès n'a pas été décrit). Les fiches descriptives se basent sur les descriptions d’habitats d’autres typologies lorsqu’elles sont disponibles et ont été complétées ou entièrement rédigées avec l’aide des experts benthologues.
Lors de cet exercice, 5 unités ont été supprimées de la typologie par manque de preuve de leur existence et 2 unités ont changé de statut de présence en France métropolitaine passant de "Présent" à "A confirmer".
Origin of data set
Fichier créé par Noëmie MICHEZ (PatriNat) et mis à jour par Marie LA RIVIERE (PatriNat).
Bibliographic references
La Rivière M., Michez N., Delavenne J., Andres S., Fréjefond C., Janson A-L., Abadie A., Amouroux J-M., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Cimiterra N., Derolez V., Fernez T., Fourt M., Frisoni G-F., Grillas P., Harmelin J-G., Jordana E., Klesczewski M., Labrune C., Mouronval J-B., Ouisse V., Palomba L., Pasqualini V., Pelaprat C., Pérez T., Pergent G., Pergent-Martini C., Sartoretto S., Thibaut T., Vacelet J., Verlaque M., 2021. Fiches descriptives des biocénoses benthiques de Méditerranée. UMS PatriNat éd., Paris : 660 pp.
Michez N., Fourt M., Aish A., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Fabri M.-C., Goujard A., Harmelin J.-G., Labrune C., Pergent G., Sartoretto S., Vacelet J., Verlaque M., 2014. Typologie des biocénoses benthiques de Méditerranée Version 2. Rapport SPN 2014 - 33, MNHN, Paris, 26 pp.
Referencing
PatriNat, 2021. Table de la typologie nationale des biocénoses benthiques de Méditerranée (NatHab-Med). UMS PatriNat / INPN, novembre 2021.
Last modification
Depuis la version 6.0 d'HABREF (décembre 2021) : modification du libellé de la typologie (NatHab-Med)
Depuis la version 5.0 d'HABREF (novembre 2019), 37 fiches descriptives ont été ajoutées et certaines fiches préalablement diffusées ont été complétées ou modifiées. Le libellé de 19 unités a été modifié (15 pour tenir compte de l'évolution de la taxonomie et 4 clarifier le cadre de l'unité). Une unité a été supprimée faute de preuves de son existence.
Depuis la version 4.0 d'HABREF (octobre 2017), 8 fiches descriptives ont été ajoutées concernant les biocénoses des substrats meubles supralittoraux, infralittoraux, circalittoraux et du bathyal.
Depuis la version 3.1 d'HABREF (janvier 2017), 13 fiches descriptives ont été ajoutées concernant les biocénoses des substrats meubles infralittoraux, le coralligène et leurs faciès.
Evolution
ATTENTION : L’évolution de la taxonomie a mené à une modification du nom d’une espèce caractéristique (Ruppia spiralis Linnaeus ex Dumortier 1827). L’association à Ruppia cirrhosa et/ou Ruppia maritima devrait ainsi être renommée comme « Association
à Ruppia spiralis (Syn. Ruppia cirrhosa) et/ou Ruppia maritima».
Facteurs abiotiques
Etage : Infralittoral
Nature du substrat : Vase, sable vaseux et sable
Répartition bathymétrique : 0 à quelques mètres
Situation : Milieu plus ou moins fermé, souvent séparé de la mer ouverte
Hydrodynamisme : Faible à moyen
Salinité : Variant de l'eau saumâtre à faible salinité à l'hypersalinité (Tolérant des fluctuations de salinité très fortes pour R. spiralis (salinité moyenne 2 – 40) et moins fortes pour R. maritima (2 – 18) (Verhoeven 1975))
Température : Variable
Lumière : Variable
Caractéristiques stationnelles
Cette association se rencontre dans des marais, étangs et lagunes à salinité variable, dans l'espace et dans le temps, éventuellement dans des estuaires dont la salinité moyenne varie entre 2 et 40 (maximum 60). Les Ruppia sont des phanérogames qui vivent immergées sur des fonds sableux ou vaseux. Ce genre est cosmopolite et les espèces Ruppia spiralis et Ruppia maritimas ont présentes dans l’ensemble de l’Europe et de la Méditerranée.
Variabilité
Ruppia maritima dans sa forme à pédoncule court et non enroulé est plutôt fréquente dans les milieux périphériques temporaires, les eaux peu profondes présentant des salinités faibles (essentiellement de 1 à 15). Elle est accompagnée de Zannichellia palustris , Chara canescens, Chara galioides et Chara aspera. Dans des milieux très peu profonds, R. maritima peut être accompagnée par Althenia filiformis, Riella helicophylla et/ou Tolypella salina. Dans les zones aux salinités les plus élevées, R. maritima est accompagnée d’Althenia filiformis et la forme à pédoncule long et enroulé (Ruppia spiralis (Syn. Ruppia cirrhosa)) apparaît. La faune a des affinités avec celles des eaux douces et est dominée par des Insectes (Hétéroptères, Odonates, Diptères).
La forme à pédoncule long et enroulé Ruppia spiralis (Syn. Ruppia cirrhosa)) est rencontrée dans des milieux permanents ou semi-permanents (assèchement court), soumis à des conditions de salinités variables, avec des moyennes essentiellement entre 3.5 et 70, mais supportant des milieux sursalés. En fonction de la salinité, elle peut être accompagnée de R. maritima, Stuckenia pectinata et/ou Zostera noltei, (et Cymodocea nodosa). La faune accompagnatrice est celle des milieux saumâtres euryhalins et eurythermes. Cette forme tolère des sédiments riches en matières organiques. Le port des feuilles proches du sédiment la rend peu compétitive face à S. pectinata et moins tolérante à la turbidité de l’eau.
Dynamique
Herbier dynamique dans le temps et dans l’espace. Le recouvrement et la biomasse peuvent changer d’une année sur l’autre selon les conditions environnementales.
Espèces caractéristiques
Althenia filiformis Petit, 1829
Chaetomorpha linum
Chara aspera C.L.Willdenow, 1809
Chara galioides A.P.De Candolle, 1813
Cladophora spp
Cymodocea nodosa (Ucria) Asch., 1869
Enteromorpha prolifera
Riella helicophylla (Bory & Mont.) Mont., 1852
Ruppia maritima Linnaeus 1753– Espèce structurante
Ruppia spiralis Linnaeus ex Dumortier 1827– Espèce structurante
Stuckenia pectinata (L.) Börner, 1912
Tolypella hispanica
Tolypella salina R.Corillion, 1960
Zannichellia palustris L., 1753
Zostera noltei Hornem., 1832
ESPECES PATRIMONIALES RENCONTREES DANS L'HABITAT
Althenia filiformis Espèce déterminante de l'inventaire ZNIEFF Languedoc-Roussillon et PACA et Arrêté du 29 octobre 1997
Cymodocea nodosa Espèce déterminante de l'inventaire ZNIEFF Corse, Languedoc-Roussillon et PACA, Convention de Berne Annexe I et Arrêté du 19 juillet 1988
Ruppia maritima Espèce déterminante de l'inventaire ZNIEFF Corse, Languedoc-Roussillon et PACA
Zostera noltei Espèce déterminante de l'inventaire ZNIEFF Corse, Languedoc-Roussillon et PACA et Arrêté du 9 mai 1994
Lamprothamnium papulosum Espèce déterminante de l'inventaire ZNIEFF Pays de la Loire (2019) et ZNIEFF Marine Corse (2010) et PACA (2005)
Riella helicophylla Directive 92/43 CEE Directive Habitats Faune Flore, Annexe II, Convention de Berne, Annexe I, Liste des espèces végétales protégées sur l’ensemble du territoire français métropolitain.
Tolypella salina Liste des espèces végétales protégées sur l’ensemble du territoire français métropolitain.
Principaux critères de reconnaissance
Présence de Ruppia maritima et Ruppia spiralis (Syn. Ruppia cirrhosa).
Habitats associés ou en contact
Les autres habitats lagunaires notamment dominés par S. pectinata ou Z. noltei
Confusions possibles
Les seules confusions possibles sont liées à la plus ou moins grande abondance de Zostera et de Stuckenia (PNUE‐PAM‐ CAR/ASP, 2007).
Les plantes encore stériles peuvent être confondues avec Zostera noltei, Stuckenia pectinata. La partie apicale des feuilles de Zostera noltei est cependant différente (présence de petites dents pour Ruppia spiralis). La fleur de Ruppia ressemble à celle du Stuckenia pectinata mais après fécondation, plusieurs tiges portent chacune un fruit.
Répartition géographique
Lagunes et étangs littoraux (étangs palavasiens, étang de Thau, étang de Leucate, étang de La Palme, étang de Canet, étang de Palo...).
.
Structure et fonctions
Forme des herbiers denses pouvant servir de frayère et de nurserie. Les herbiers sont consommés par les anatidés herbivores et granivores et les foulques.
Intérêt pour la conservation
Les peuplements de Ruppia offrent une source de nourriture importante pour les oiseaux, des zones de frai pour les poissons, des abris pour les alevins et sont le support de nombreux invertébrés (PNUE‐PAM‐ CAR/ASP, 2007).
Menaces potentielles
La vulnérabilité et les menaces sur cette Association sont celles de la Biocénose de rattachement et notamment les remblaiements et activités d'urbanisation et l’eutrophisation.
Auteur(s)
Michez N., Cimiterra N., Derolez V., Grillas P., Ouisse V.
Date de rédaction
2021
Bibliography
La Rivière M., Michez N., Delavenne J., Andres S., Fréjefond C., Janson A-L., Abadie A., Amouroux J-M., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Cimiterra N., Derolez V., Fernez T., Fourt M., Frisoni G-F., Grillas P., Harmelin J-G., Jordana E., Klesczewski M., Labrune C., Mouronval J-B., Ouisse V., Palomba L., Pasqualini V., Pelaprat C., Pérez T., Pergent G., Pergent-Martini C., Sartoretto S., Thibaut T., Vacelet J., Verlaque M., 2021. Fiches descriptives des biocénoses benthiques de Méditerranée. UMS PatriNat éd., Paris : 660 pp. (Source)
Michez N., Dirberg G., Bellan-Santini D., Verlaque M., Bellan G., Pergent G., Pergent-Martini C., Labrune C., Francour P., Sartoretto S., 2011. Typologie des biocénoses benthiques de Méditerranée, Liste de référence française et correspondances. Rapport SPN 2011 - 13, MNHN, Paris, 50 p. (Source)
Michez, N., Fourt, M., Aish, A., Bellan, G., Bellan-Santini, D., Chevaldonné, P., Fabri, M.-C., Goujard, A., Harmelin, J.-G., Labrune, C., Pergent, G., Sartoretto, S., Vacelet, J. et Verlaque, M. 2014. Typologie des biocénoses benthiques de Méditerranée Version 2. Service du patrimoine naturel, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris. SPN 2014 - 33: 26 pp. (Source)
Beirinckx L, Vanschoenwinkel B, Triest L. 2020. Hidden Hybridization and Habitat Differentiation in a Mediterranean Macrophyte, the Euryhaline Genus Ruppia. Front Plant Sci [Internet]. [accessed 2020 Oct 25] 11. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2020.00830/full
Ito Y., Ohi-Toma T., Nepi C., Santangelo A., Stinca A. Tanaka N., Murata J. 2017. Towards a better understanding of the Ruppia maritima complex (Ruppiaceae): Notes on the correct application and typification of the names R. cirrhosa and R. spiralis. Taxon 66(1): 167-171.
Mannino AM, Menéndez M, Obrador B, Sfriso A, Triest L. 2015. The genus Ruppia L. (Ruppiaceae) in the Mediterranean region: An overview. Aquatic Botany. 124:1–9.
Oheix J., Ouisse V., Munaron D., Le Fur I., Derolez V. 2015. Etude de Ruppia cirrhosa dans la lagune de Canet‐St‐Nazaire . RST.ODE/UL/LER/LR/15-29. https://archimer.ifremer.fr/doc/00280/39091/
Orfanidis S., Panayotidis P., & Ugland K. I. 2011. Ecological evaluation Index continuous formula (EEI-c) application : a step forward for functional groups, the formula and reference condition values. Mediterranean Marine Science 12/1 199-231.
PNUE, PAM, CAR/ASP, 2007. Manuel d’interprétation des types d'habitats marins pour la sélection des sites à inclure dans les inventaires nationaux de sites naturels d’intérêt pour la Conservation. Pergent G., Bellan-Santini D., Bellan G., Bitar G. et Harmelin J.G. eds., CAR/ASP publ., Tunis, 199 pp.
Rodríguez-Pérez H, Green AJ., 2006. Waterbird impacts on widgeongrass Ruppia maritima in a Mediterranean wetland: comparing bird groups and seasonal effects. Oikos. 112(3): 525–534.
VERHOEVEN J.T.A., 1980. The ecology of Ruppia-dominated communities in western Europe. II. Synecological classification, structure and dynamics of the macroflora and macrofauna communities. Aquatic Biology, 8 : 1-85.
Verhoeven JTA 1975. Ruppia-communities in the camargue, France. Distribution and structure in relation to salinity and salinity fluctuations. Aquatic Botany. 1:217–241.