Typologie nationale des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l'Atlantique (NatHab-Atl)
Date de mise à jour du jeu de données
01/03/2019
Auteurs de la typologie
Noëmie Michez (UMS 2006 PATRINAT), Annabelle Aish (MNHN-SPN), Ann C. Andersen (ABICE/UMR 7144/ Sorbonne Université), Erwan Ar Gall (LEMAR/UMR 6539/IUEM), Alexandrine Baffreau (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Touria Bajjouk (LEBCO/DYNECO/IFREMER), Hugues Blanchet (EPOC/UMR 5805/Université de Bordeaux), Pauline Cajeri (LIENSs/UMR 7266/Université de La Rochelle), Pauline Chauvet (LEP/EEP/IFREMER), Jean-Claude Dauvin (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Dominique Davoult (EFEB/UMR 7144/ Sorbonne Université), Thibaut de Bettignies (UMS 2006 PATRINAT), Marie-Noëlle de Casamajor (LRHAQ/IFREMER), Sandrine Derrien-Courtel (Station de Biologie Marine de Concarneau/MNHN), Stanislas Dubois (LEBCO/DYNECO/IFREMER), Marie-Claire Fabri (LERPAC/LITTORAL/IFREMER), Aurélie Foveau (FBN/LELRA/IFREMER), Franck Gentil (DIVCO/UMR 7144/ Sorbonne Université), Brigitte Guillaumont (LEP/EEP/IFREMER), Jacques Grall (UMS 3113/IUEM/UBO), Christian Hily (LEMAR/CNRS/IUEM/UBO), Céline Houbin (Station Biologique de Roscoff/OSU), Anne-Laure Janson (UMS 2006 PATRINAT), Marie La Rivière (UMS 2006 PATRINAT), Laurent Lévèque (Station Biologique de Roscoff/OSU), Line Le Gall (ISYEB/UMR 7205/MNHN), Sophie Lozach (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Lénaick Menot (LEP/EEP/IFREMER), Josiane Popovsky (IMA), Céline Rolet (LOG/UMR 8187/Université Lille 1), Thierry Ruellet (GEMEL), Pierre-Guy Sauriau (LIENSs/UMR 7266/Université de La Rochelle), Nathalie Simon (AD2M/UMR 7144/Sorbonne Université), Laurent Soulier (IMA), Eric Thiébaut (DIVCO/UMR 7144/ Sorbonne Université), Julie Tourolle (LEP/EEP/IFREMER), Inge Van den Beld (LEP/EEP/IFREMER)
Auteurs de la table
PatriNat
Territoire(s) concerné(s)
Manche, Mer du Nord et Atlantique français
Organisme responsable
PatriNat
Langue d'origine des données
FR
Contexte
Compte tenu de l’intérêt grandissant des politiques publiques pour le milieu marin et de l’actualité chargée des différents programmes de gestion, de conservation ou d’inventaire (inventaires ZNIEFF, inventaire biologique et analyse écologique des habitats marins patrimoniaux des sites N2000 et des PNM, Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin, Système d’Information sur la Nature et le Paysage), le besoin de cohérence est élevé. Le développement de ces programmes nécessite la mise en place et l’utilisation d’outils tels que les référentiels. Ils permettent de définir un langage commun ainsi que les unités de travail. Parmi ces référentiels, il existe plusieurs classifications des habitats benthiques. Créées dans des contextes particuliers, elles répondent à des objectifs donnés, soit de connaissance et d’inventaire comme la typologie des ZNIEFF-Mer (Dauvin et al., 1994), soit de gestion et de conservation comme la typologie des habitats d’intérêt communautaire de l’Union Européenne (European Commission, 2007). Ces outils, adaptés à leur problématique, se rapportent à des échelles différentes : européenne pour Natura 2000 et EUNIS, nationale ou régionale pour les ZNIEFF. Il était nécessaire d’homogénéiser et d’harmoniser ces référentiels existants. Pour cela un nouveau référentiel national des habitats marins benthiques a été créé en synthétisant cet existant et en le complétant. Il est composé de deux typologies : une relative aux biocénoses de Méditerranée et l’autre concernant les habitats de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Son utilisation est préconisée pour l’ensemble des programmes ayant trait à la conservation des habitats marins à l’échelle nationale.
Description du travail
Cette typologie sert de référence à l’échelle nationale pour les habitats marins benthiques présents en Manche, en Mer du Nord et en Atlantique.
Sa première version, parue en 2013 (rapport explicatif Michez et al., 2013), était intégralement basée sur la proposition de typologie du REBENT (Guillaumont et al., 2008 et Bajjouk et al., 2011) à laquelle des habitats identifiés dans la bibliographie ou émanant de la communauté scientifique avaient été intégrés ainsi que certains habitats de la classification EUNIS (2008). Elle contenait 458 unités réparties en 7 niveaux. Suite à l’acquisition de nouvelles informations sur les habitats marins benthiques, une mise à jour de la typologie était nécessaire pour qu’elle soit le reflet des connaissances actuelles et a abouti à une deuxième version parue en 2015 (rapport explicatif Michez et al., 2015). Elle incluait 565 unités réparties en 6 niveaux. La version actuelle, la version 3, est parue en 2019 (rapport explicatif Michez et al., 2019). Elle comporte 664 unités hiérarchisées selon 5 niveaux. Par rapport à la version 2, le premier niveau hiérarchique a entièrement été modifié par soucis de cohérence avec la mise à jour d’EUNIS. Il se compose de 28 unités qui sont des combinaisons d’un étage et d’un type de substrat (par exemple les roches infralittorales). De nouveaux habitats ont été ajoutés, la codification a été totalement revisitée et la terminologie a été homogénéisée.
La collaboration de nombreux experts benthologues a été primordiale pour l'établissement et la consolidation de ce référentiel.
Origine du jeu de données
Fichier créé par Noëmie Michez et mis à jour par Marie La Rivière, Juliette Delavenne et Salomé Andres (PatriNat)
Références bibliographiques
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Référencement
PatriNat, 2023. Table de la typologie nationale des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l'Atlantique (NatHab-Atl). Base de données HabRef v7.
Dernière modification
Depuis la version 5.0 d'HABREF (novembre 2019), modifications de la version 3 de la typologie incluses dans la version 7.0 d'HABREF : 108 fiches descriptives complètes ont été ajoutées pour toutes les unités de niveau 2 et certains champs descriptifs ont été remplis pour 320 fiches de niveau 3 ou 4. Le libellé de 10 unités a été modifié (5 pour tenir compte de l'évolution de la taxonomie et 5 pour clarifier le cadre de l'unité). Une unité de niveau 3 a été supprimée et les 2 unités de niveau 4 qu'elle incluait ont été déplacées. Le statut de présence en France de 22 unités a été modifié en incertain (à confirmer).
Version 3 de la typologie incluse dans la version 5.0 d’HABREF, pour plus d’explications sur les modifications opérées dans cette version de la typologie se reporter au rapport : Michez N., Thiébaut E., Dubois S., Le Gall L., Dauvin J.C., Andersen A. C., Baffreau A., Bajjouk T., Blanchet H., de Bettignies T., de Casamajor M.-N., Derrien-Courtel S., Houbin C., Janson A.L., La Rivière M., Lévèque L., Menot L., Sauriau P.G., Simon N., Viard F., 2019. Typologie des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Version 3. UMS PatriNat, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, 52 p.
Source de l'ajout à la typologie
L’habitat B6-2 Vases sableuses infralittorales eutrophisées était déjà dans la version 1 de la typologie (Michez et al., 2013) sous le code M10.01.02. La dénomination reste identique mais le code change dans la version 3 de la typologie (Michez et al., 2019).
Facteurs abiotiques
Etage : Infralittoral
Nature du substrat : Vases sableuses
Répartition bathymétrique : 0-20 m environ [Dépend de la pénétration de la lumière, ce qui est très variable selon les sites. S’étend jusqu’où l’intensité lumineuse est compatible avec la vie des macrophytes photophiles]
Hydrodynamisme : Faible à modéré
Salinité : Milieu marin [sous influence estuarienne en période de crue]
Température : Cyclotherme saisonnier
Lumière : Système phytal ; Eaux turbides
Régime trophique : Eutrophisé
Caractéristiques stationnelles
Vases sableuses eutrophisées de la zone infralittorale, retrouvées dans des secteurs très abrités tels que les baies, les bras de mer, les rades et les milieux portuaire à l’abri des houles et des courants de marée. Ces vasières sont soumises à une pollution organique liée aux déversements d’activités agricoles, industrielles ou urbaines des bassins versants ou plus directement à des activités aquacoles ou des rejets d’eau usée aux alentours. La sédimentation active de matériaux fins, provenant en majorité des fleuves, et le faible renouvellement des eaux favorisent l’accumulation de matière organique dans le substrat. Cet enrichissement peut être aussi d’origine naturelle, due par exemple aux réjections d’oiseaux côtiers concentrés sur un même site. La dégradation de la matière organique par les processus de minéralisation bactérienne induit une forte consommation en oxygène dissous pouvant engendrer une hypoxie voire une anoxie des sédiments superficiels. La diversité de la faune endogée dépend de l’intensité de l’eutrophisation. Plus elle est importante, plus la richesse spécifique diminue alors que les espèces benthiques opportunistes, résistantes aux perturbations physico-chimiques, prolifèrent dans l’espace libéré. Les peuplements opportunistes comprennent typiquement les annélides polychètes de la famille des Capitellidae et des Spionidae, particulièrement adaptées à un enrichissement excessif du milieu et à de faibles teneurs en oxygène.
Variabilité
La variabilité est liée à l’intensité de l’enrichissement organique et à la composition du substrat (rapport sable:vase compris entre 1:9 et 1:1). Les apports organiques et sédimentaires dépendent des débits fluviaux et de l’hydrodynamisme local qui influent sur le renouvellement en eau. Le substrat est plus ou moins cohésif, chargé en matière organique et oxygéné selon les conditions environnementales et la pression de pollution. Tous ces facteurs conditionnent la biocénose en présence. Avec l'augmentation de l'enrichissement organique, la richesse spécifique diminue alors que les espèces benthiques opportunistes résistantes à la pollution organique et aux faibles teneurs en oxygène prolifèrent dans l’espace libéré. Néanmoins, au stade ultime d’eutrophisation, avec une absence totale d’oxygène, toute vie macrofaunique disparaît et est remplacée notamment par des bactéries, et parfois certaines espèces de foraminifères, adaptées à ces conditions extrêmes. Selon le degré d’eutrophisation on peut notamment trouver les deux sous-habitats décrits dans leurs fiches respectives.
Communautés ou espèces caractéristiques
L’habitat B6-2 ne se reconnait pas par des espèces caractéristiques mais par la bathymétrie et le type de substrat.
Espèces associées
Dans le cadre de cette fiche, les espèces associées ont été définies comme les espèces les plus fréquemment citées dans la littérature pour cet habitat.
Dynamique temporelle
La sédimentation des particules fines et l’accumulation de matière organique ont lieu principalement en période estivale, lorsque l’hydrodynamisme (courants marins, de marée, houle et vents) est au plus faible dans les milieux abrités. C’est également la période où le potentiel d’oxydo-réduction de l’activité bactérienne est à son maximum dans l’épaisseur sédimentaire. Il atteint en effet l’interface eau-sédiment en été alors qu’il se cantonne à quelques centimètres de profondeur durant la saison froide. Cette discontinuité est aussi corrélée à l’hydrodynamisme. Les turbulences de la saison hivernale favorisent la circulation de l’eau interstitielle dans le sédiment compact et permet ainsi une meilleure diffusion de l’oxygène tandis que l’été est synonyme de renouvellements en eau parfois inexistants dans les milieux abrités.
Ces conditions estivales engendrent à terme des phénomènes d’eutrophisation qui se traduisent par l’hypoxie voire l’anoxie des sédiments. Les espèces opportunistes adaptées à ces perturbations présentent ainsi des cycles d’abondance qui suivent l’évolution des conditions d’eutrophisation.
Habitats pouvant être associés ou en contact
L’habitat B6-2 peut potentiellement être en contact avec les habitats suivants :
En contact supérieur avec les habitats médiolittoraux :
- A2-1 Récifs de moules (moulières) médiolittoraux
- A2-2 Récifs d'huîtres médiolittoraux
- A4-1 Sédiments hétérogènes envasés médiolittoraux marins
- A4-2 Sédiments hétérogènes envasés médiolittoraux en milieu à salinité variable
- A5-4 Sables fins envasés médiolittoraux
- A5-3 Sables fins médiolittoraux
- A5-5 Sables médiolittoraux en milieu à salinité variable
- A5-6 Herbiers à Zostera noltei sur sables médiolittoraux
- A5-7 Herbiers à Zostera marina sur sables médiolittoraux
- A6-1 Vases médiolittorales marines
- A6-4 Herbiers à Zostera noltei sur vases médiolittorales
En contact de même niveau bathymétrique ou en association avec :
- B1 Roches ou blocs infralittoraux (et ses déclinaisons)
- B2-1 Récifs de moules (moulières) infralittoraux
- B2-2 Récifs d'huîtres infralittoraux
- B2-3 Récifs de polychètes tubicoles infralittoraux
- B4-1 Sédiments hétérogènes infralittoraux
- B4-2 Sédiments hétérogènes infralittoraux en milieu à salinité variable
- B4-3 Bancs de maërl sur sédiments hétérogènes envasés infralittoraux
- B4-4 Herbiers à Zostera marina sur sédiments hétérogènes infralittoraux
- B5-1 Sables fins à moyens mobiles infralittoraux
- B5-2 Sables fins propres infralittoraux
- B5-3 Sables fins envasés infralittoraux
- B5-4 Sables mobiles infralittoraux en milieu à salinité variable
- B5-5 Herbiers à Zostera marina sur sables infralittoraux
- B5-6 Herbiers à Ruppia maritima sur sables infralittoraux
- B6-1 Vases sableuses infralittorales non eutrophisées
- B6-3 Vases infralittorales
- B6-4 Vases infralittorales en milieu à salinité variable
En contact inférieur avec les habitats circalittoraux :
- C2-1 Récifs de Mytilidae (moulières) du circalittoral côtier
- C2-2 Récifs de polychètes tubicoles du circalittoral côtier
- C4-1 Sédiments hétérogènes circalittoraux côtiers
- C5-2 Sables fins propres ou envasés circalittoraux côtiers
- C6-1 Vases sableuses circalittorales côtières
- C6-2 Vases circalittorales côtières
Confusions possibles
Dans les sites potentiellement pollués, il peut y avoir confusion avec l’habitat B6-1 Vases sableuses infralittorales non eutrophisées en fonction du degré et de l’étendue du phénomène de pollution.
Confusion possible avec l’habitat B6-3 Vases infralittorales selon l’appréciation de la granulométrie du sédiment sur le terrain. Des analyses bio-sédimentaires complètes en laboratoire pourront permettre de distinguer ces deux habitats.
Une confusion d’ordre altitudinale peut aussi avoir lieu avec les habitats A6-1 Vases médiolittorales marines et C6-1 Vases sableuses circalittorales côtières. Le relevé des coordonnées GPS couplé aux cartes marines permet de faire la distinction.
En limite d’estuaire, cet habitat peut être facilement confondu avec l’habitat B6-4 Vases infralittorales en milieu à salinité variable.
Répartition géographique
Les vases infralittorales eutrophisées sont potentiellement observables dans les rades portuaires, les baies et autres milieux maritimes semi-fermés soumis à des apports organiques excessifs. Elles ont notamment été recensées en rade de Brest.
Fonctions écologiques
Dans un milieu eutrophisé, seules quelques espèces ubiquistes et opportunistes prolifèrent en présentant des pics d’abondances qui peuvent atteindre plusieurs milliers d’individus au 0,1 m². C’est le cas des polychètes du genre Capitella, Scolelepis et Chaetozone qui ont un cycle de vie court à fort potentiel de reproduction. Leur activité souterraine maintient une teneur en eau interstitielle et donc en oxygène dans les sédiments, ce qui contribue au maintien du système d’oxydo-réduction. La production bactérienne est de plus favorisée par l’augmentation de matière organique induite par les fèces de cette faune endogée.
Dans les cas les plus extrêmes d’eutrophisation, comme aux abords d’émissaires en situation confinée (front de port par exemple), la vie macrofaunique peut disparaître et laisser place aux organismes vivants à mécanismes anaérobies. Parmi eux, en plus des bactéries, on peut retrouver quelques espèces de foraminifères.
Les sédiments eutrophisés sont souvent associés à des eaux de mauvaise qualité. La pollution organique généralisée représente une barrière hydrologique pour les consommateurs d’invertébrés benthiques habituellement inféodés aux vases sableuses tels que les soles et les mulets. Ces milieux sont ainsi particulièrement stériles.
Statut de conservation
Au titre de la DHFF (92/43/CEE), l’habitat B6-2 peut correspondre à l’HIC 1130 « Estuaires », à l’HIC 1150 « Lagunes côtières » ou à l’HIC 1160 « Grandes criques et baies peu profondes » sous réserve de respect des critères d'identification géomorphologiques et de délimitation physiographiques de l'HIC. Il peut également correspondre à l’HIC 8330 « Grottes marines » sous réserve de respect des critères d’identification de l’HIC (notamment de seuil de taille).
Tendance évolutive
Sans mesure de protection mise en place pour contrer la pollution organique, les vases sableuses eutrophisées peuvent tendre vers l’un des deux sous-habitats décrits dans la section Variabilité. Néanmoins, ces dernières années, la réglementation concernant les rejets urbains en mer, en application à la directive européenne du 21 mai 1991, permet peu à peu d’améliorer les réseaux d’assainissement et les techniques d’épuration du territoire français. Cette mise aux normes progressive dans les différentes agglomérations et leurs suivis devraient à terme permettre de diminuer l’occurrence de cet habitat.
Auteur(s)
Latry L., Blanchet H.
Date de rédaction
2020
Bibliographie
Michez N., Aish A., Hily C., Sauriau P.-G., Derrien-Courtel S., de Casamajor M.-N., Foveau A., Ruellet T., Lozach S., Soulier L., Popovsky J., Blanchet H., Cajeri P., Bajjouk T., Guillaumont B., Grall J., Gentil F., Houbin C., Thiébaut E., 2013. Typologie des habitats marins benthiques français de Manche, de Mer du Nord et d'Atlantique : Version 1. Rapport SPN 2013 - 9, MNHN, Paris, 32 p. (Source)
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