La ZNIEFF du bois de Riencourt et du Fayel abrite une multitude d’habitats dont certains sont remarquables à l’échelle de la région :
- Des formations forestières acidiclines : forêts à Hêtre commun et Oxalide oseille (Oxalido acetosellae - Fagetum sylvaticae), rares en région et inscrites à l’annexe I de la directive européenne Habitats-Faune-Flore.
- Des forêts à Erable champêtre et Mercuriale vivace (Mercuriali perennis - Aceretum campestris), peu communes et inscrites à l’annexe I de la directive européenne Habitats-Faune-Flore.
- Des forêts à Hêtre commun et Jacinthe des bois (Endymio non-scriptae - Fagetum sylvaticae), également peu communes et inscrites à l’annexe I de la directive européenne Habitats-Faune-Flore.
- Des végétations d'ourlets thermocalcicoles du Trifolion medii, assez communes en région mais dont certaines associations peuvent être menacées.
- Des végétations annuelles commensales des cultures sur sols calcaires (Centaureetalia cyani) dont on connait encore mal la répartition en région.