La cartographie des habitats a été réalisée en 2022, elle met en évidence les végétations suivantes:
- une zone écorchée pionnière sur sol sablo-calcaire relevant du Sileno conicae - Cerastion semidecandri ;
- une zone aride riche en Orpins et en Koelerie à grandes fleurs relevant du Koelerio macranthae - Phleion phleoidis ;
- plusieurs clairières plus mésophiles, évoluant probablement de la végétation précédente, sont rattachables au Poo angustifoliae - Arrhenatherenion elatioris ;
- la grande majorité du site, sur la terrasse alluviale haute, est par ailleurs occupée par des fourrés à Prunellier (rattachement probable au Pruno fruticantis - Evonymetum europaei) et par de jeunes forêts à Orme champêtre et Frêne élevé (Ulmo minoris - Quercetum roboris) ;
- les végétations inondables du bord de Cher et des îles sont rattachables au Rubo caesi - Populion nigrae et très ponctuellement au Salicion triandrae ;
- les herbiers aquatiques du Cher, dominées par le Potamot noueux et le Potamot pectiné sont rattachables au Batrachion fluitantis.