La moitié sud du site est diversifiée en habitats, contrairement à la partie nord, plus forestière. Au nord, sur la route forestière de la Joux, de petits coteaux herbeux enclavés dans la matrice forestière abritent la pelouse sèche à Danthonie décombante et Brachypode penné. Les accotements thermophiles de pistes, les ceintures de fourrés, abritent l’ourlet à Origan et Brachypode penné. La matrice forestière est composée notamment d’une hêtraie-sapinière montagnarde à Orge d’Europe. Les coupes à blanc récentes comportent des végétations pas assez installées pour être caractérisées. Au centre, la route D14E2 fragmente une pelouse marnicole montagnarde plutôt à Calamagrostide bigarrée et Molinie élevée. Les corniches en bord de route abritent des pelouses primaires xérothermophiles à Coronille engainée et Laîche humble ou à Laîche humble et Brôme erigé. S’y trouvent également des végétations chasmophytiques à Capillaire des murailles et Doradille des murailles. De larges dalles exposées au sud à Très-le-Mur et à la pointe Sud du site, sont occupées par des pelouses (par exemple à Mélique ciliée). En dehors de ces particularités stationnelles, au centre du site à Très-le-Mur et sur la partie Sud, les pelouses à Gentiane printanière et Brôme érigé. Elles sont en mosaïque avec le fourré à Nerprun des Alpes et Alisier blanc. Aux Lidoux, une pelouse à Gentiane jaune et Crételle occupe les accotements de piste. D’un point de vue floristique, seule la Gentiane croisette a été retrouvée au lieu-dit sur la Côte.
Approx 1% du site - Asplenietum trichomano - rutae-murariae Kühn 1937 (CB 62.15, EUNIS E3.25, EUR 28 : 8210-9) Approx 2% du site - Calamagrostio variae – Molinietum litoralis J.-M. Royer in Ferrez et al. 2011 (CB 34.322B, EUNIS E1.262B, EUR 28 : 6210-21) Approx 2% du site - Carici humilis - Brometum erecti (Kuhn) Zielonkowski 1973 (CB 34.322B, EUNIS E1.262B, EUR 28 : 6210-24) Approx 2% du site - Coronillo vaginalis – Caricetum humilis J.-L. Rich. (1972) 1975 (CB 34.3328, EUNIS E1.2728, EUR 28 : 6210-34) Approx 10% du site - Cotoneastro integerrimae - Amelanchieretum ovalis Faber ex Korneck 1974 (CB 31.82, EUNIS F3.12, EUR 28 : 5110-2) Approx 5% du site - Gentiano luteae - Cynosuretum cristati (B.Foucault et Gillet) Ferrez 2007 (CB 38.1, EUNIS E2.1) Approx 0% du site - Gentiano vernae – Brometum erecti Kuhn ex Oberd. 1957 (CB 34.322B, EUNIS E1.262B, EUR 28 : 6210-15) Approx 10% du site - Groupement à Juniperus communis (CB 31.88, EUNIS F3.16, EUR 28 : 5130) Approx 50% du site - Hordelymo europae - Fagetum sylvaticae (Kuhn) Jahn 1972 (CB 41.131, EUNIS G1.63, EUR 28 : 9130-9) Approx 1% du site - Melico ciliatae – Centranthetum angustifolii Ferrez in Ferrez et al. 2011 (CB 34.35, EUNIS E1.292, EUR 28 : 6110-34) Approx 3% du site - Origano - Brachypodietum pinnati Moor 1952 (CB 34.42, EUNIS E5.22) Approx 3% du site - Sieglingio decumbentis – Brachypodietum pinnati Zielonkowski 1973 (CB 34.322, EUNIS E1.262, EUR 28 : 6210-17)
Autres habitats :
Approx 2% du site - Alysso alyssoidis - Sedion albi Oberd. et T.Müll. in T.Müll. 1961 (CB 34.11, EUNIS E1.11, EUR 28 : 6110*) Approx 20% du site - Convallario majalis - Coryletum avellanae Guinochet 1955 (CB 31.81, EUNIS F3.11)
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