La forêt d'Echallon est une hêtraie-sapinière de l'étage montagnard, située aux pieds du massif jurassien. Elle matérialise la limite nord des massifs forestiers du Haut-Bugey, le "Bugey noir". Ses attraits naturalistes sont multiples : vaste superficie occupée ici et là par des mégaphorbiaies (formations à hautes herbes), contacts avec différents milieux (prairies, lacs, tourbières…)... Il est néanmoins difficile d'en apprécier la réelle valeur biologique car, comme nombre de massifs forestiers, elle reste peu parcourue par les naturalistes. La Bécasse des bois apprécie particulièrement les zones marécageuses présentes dans le sous-bois; la parade nuptiale a lieu en sous-bois dégagé. La gélinotte, typique des hêtraies-sapinières de l'étage montagnard, est aussi présente. La présence de cette espèce sur une bonne partie du haut et moyen Jura ne doit pas faire oublier que l'espèce est en régression, particulièrement à basse altitude, et que sa présence en France se cantonne presque exclusivement aux massifs vosgiens, jurassiens et alpiens. La forêt d'Echallon abrite également l'une des dernières stations connues dans l'arc jurassien du très menacé Sabot de Vénus.