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Le site de la basse vallée de l’Aliso et du Poggio se trouve à la sortie sud de Saint-Florent sur les communes de Saint-Florent et d’Oletta. Il s'agit de zones basses comprises entre la rivière Aliso et le ruisseau de Poggio. Ces zones sont essentiellement occupées par des sansouires (au sud) et des roselières et des aulnaies (au nord).
La végétation présente de nombreuses mosaïques, liées aux conditions particulières du milieu. Au niveau des marais, le facteur hydrique est capital dans le déterminisme des groupements végétaux. Il joue par la nature de l’eau (plus ou moins salée) et par la durée des périodes de submersion ou d’émersion des zones basses. Les importantes fluctuations du niveau de l’eau et de la salinité ne permettent l’installation que de très peu d’espèces, les plus euryhalines. Parmi elles, les salicornes vivaces (Sarcocornia fruticosa) occupent la plus grande partie du site, en mosaïque avec de vastes zones à suéda ligneuse (Suaeda vera). Aux endroits où le pâturage est absent, ces formations sont très denses et la végétation peu diversifiée. La micro-topographie joue également un rôle important, puisque les zones légèrement plus basses, s’asséchant moins vite en été sont colonisées par des salicornes annuelles (Salicornia patula, Salicornia emerici). Le bord des canaux est occupé par des tamaris (Tamarix africana) et des groupements à inule (Limbarda crithmoides), jonc piquant (Juncus acutus), aster tricolore (Tripolium pannonicum), spergulaire maritime (Spergularia media), obione (Halimione portulacoides)…
En remontant vers le Chioso Vescovo, à l’est du marais de Fagiolo, on trouve tout d’abord :
- des jonchaies à Juncus acutus et guimauve officinale (Althaea officinalis) ;
- le long des canaux, des formation à scirpe maritime (Bolboschoenus maritimus), fétuque (Festuca arundinacea), lotier glabre (Lotus glaber) ;
- des haies à ronce (Rubus ulmifolius), bonjéania érigée (Dorycnium rectum), orme (Ulmus minor), quelques alaternes (Rhamnus alaternus), des lianes (Rosa sempervirens, Humulus lupulus, Vitis vinifera,…) ;
- enfin, des prairies sèches en friche, à graminées et légumineuses, envahies par des carlines (Carlina corymbosa), des asphodèles (Asphodelus ramosus) ou des ronces. C’est dans ces prairies qu‘ont été trouvés le sérapias à petites fleurs (Serapias parviflora), espèce protégée et déterminante et la globulaire allongée (Globularia bisnagarica), espèce très rare en Corse.
Au sud de la RD 82, les zones les plus élevées sont colonisées par diverses légumineuses (Lathyrus annuus, Vicia bithynica, Vicia sativa subsp. nigra,…) et par des chrysanthème de Mycène (Coleostephus myconis).
Enfin, on trouve à l’extrémité nord du site, près de la station d’épuration, une vaste roselière à Phragmites australis et scirpe maritime (Bolboschoenus maritimus). Cette zone a été partiellement comblée pour permettre l’installation de hangars. A l’arrière des roselières, se trouve de beaux peuplements d’aulnes glutineux.
La création d’une ZNIEFF sur le site de la basse vallée de l’Aliso et du Poggio se justifie par la présence de marais à salicornes
annuelles et vivaces, à suéda ligneuse et à tamaris. Ces formations, sans doute beaucoup plus étendues dans le passé, subissent depuis le XIXème siècle, de nombreux impacts
anthropiques : création de réseaux de drainage et d’assainissement, aménagements divers, comblements. Ainsi, les surfaces occupées par ces formations continuent à se réduire et nécessitent une protection et une attention particulières. Ce sont également des milieux dans lesquels on note la présence d’espèces végétales et animales à forte valeur patrimoniale, car assez rares ou localisées en Corse.
Le périmètre de la ZNIEFF a été défini de façon à intégrer toutes les sansouires qui présentent un « intérêt fonctionnel » dans le système hydrologique du site (terrains inondables et bassin naturel
d’expansion des crues) et les milieux périphériques (haies, mégaphorbaies, prairies humides). Une partie des prairies en friche située à l’est du site (lieu-dit Chioso Vescovo) a été intégrée au périmètre, en raison de la présence d’une espèce végétale déterminante : Serapias parviflora et d’une espèce très rare en Corse : Globularia bisnagarica. La limite nord du site a été étendue aux roselières et aux aulnaies (habitat déterminant) situées en rive gauche du ruisseau de Poggio, car ces zones sont intéressantes au niveau faunistique. Certaines prairies ont également été jointes en raison de leur richesse en orchidées.
