Typologie nationale des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l'Atlantique (NatHab-Atl)
Date de mise à jour du jeu de données
01/03/2019
Auteurs de la typologie
Noëmie Michez (UMS 2006 PATRINAT), Annabelle Aish (MNHN-SPN), Ann C. Andersen (ABICE/UMR 7144/ Sorbonne Université), Erwan Ar Gall (LEMAR/UMR 6539/IUEM), Alexandrine Baffreau (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Touria Bajjouk (LEBCO/DYNECO/IFREMER), Hugues Blanchet (EPOC/UMR 5805/Université de Bordeaux), Pauline Cajeri (LIENSs/UMR 7266/Université de La Rochelle), Pauline Chauvet (LEP/EEP/IFREMER), Jean-Claude Dauvin (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Dominique Davoult (EFEB/UMR 7144/ Sorbonne Université), Thibaut de Bettignies (UMS 2006 PATRINAT), Marie-Noëlle de Casamajor (LRHAQ/IFREMER), Sandrine Derrien-Courtel (Station de Biologie Marine de Concarneau/MNHN), Stanislas Dubois (LEBCO/DYNECO/IFREMER), Marie-Claire Fabri (LERPAC/LITTORAL/IFREMER), Aurélie Foveau (FBN/LELRA/IFREMER), Franck Gentil (DIVCO/UMR 7144/ Sorbonne Université), Brigitte Guillaumont (LEP/EEP/IFREMER), Jacques Grall (UMS 3113/IUEM/UBO), Christian Hily (LEMAR/CNRS/IUEM/UBO), Céline Houbin (Station Biologique de Roscoff/OSU), Anne-Laure Janson (UMS 2006 PATRINAT), Marie La Rivière (UMS 2006 PATRINAT), Laurent Lévèque (Station Biologique de Roscoff/OSU), Line Le Gall (ISYEB/UMR 7205/MNHN), Sophie Lozach (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Lénaick Menot (LEP/EEP/IFREMER), Josiane Popovsky (IMA), Céline Rolet (LOG/UMR 8187/Université Lille 1), Thierry Ruellet (GEMEL), Pierre-Guy Sauriau (LIENSs/UMR 7266/Université de La Rochelle), Nathalie Simon (AD2M/UMR 7144/Sorbonne Université), Laurent Soulier (IMA), Eric Thiébaut (DIVCO/UMR 7144/ Sorbonne Université), Julie Tourolle (LEP/EEP/IFREMER), Inge Van den Beld (LEP/EEP/IFREMER)
Auteurs de la table
PatriNat
Territoire(s) concerné(s)
Manche, Mer du Nord et Atlantique français
Organisme responsable
PatriNat
Langue d'origine des données
FR
Contexte
Compte tenu de l’intérêt grandissant des politiques publiques pour le milieu marin et de l’actualité chargée des différents programmes de gestion, de conservation ou d’inventaire (inventaires ZNIEFF, inventaire biologique et analyse écologique des habitats marins patrimoniaux des sites N2000 et des PNM, Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin, Système d’Information sur la Nature et le Paysage), le besoin de cohérence est élevé. Le développement de ces programmes nécessite la mise en place et l’utilisation d’outils tels que les référentiels. Ils permettent de définir un langage commun ainsi que les unités de travail. Parmi ces référentiels, il existe plusieurs classifications des habitats benthiques. Créées dans des contextes particuliers, elles répondent à des objectifs donnés, soit de connaissance et d’inventaire comme la typologie des ZNIEFF-Mer (Dauvin et al., 1994), soit de gestion et de conservation comme la typologie des habitats d’intérêt communautaire de l’Union Européenne (European Commission, 2007). Ces outils, adaptés à leur problématique, se rapportent à des échelles différentes : européenne pour Natura 2000 et EUNIS, nationale ou régionale pour les ZNIEFF. Il était nécessaire d’homogénéiser et d’harmoniser ces référentiels existants. Pour cela un nouveau référentiel national des habitats marins benthiques a été créé en synthétisant cet existant et en le complétant. Il est composé de deux typologies : une relative aux biocénoses de Méditerranée et l’autre concernant les habitats de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Son utilisation est préconisée pour l’ensemble des programmes ayant trait à la conservation des habitats marins à l’échelle nationale.
Description du travail
Cette typologie sert de référence à l’échelle nationale pour les habitats marins benthiques présents en Manche, en Mer du Nord et en Atlantique.
Sa première version, parue en 2013 (rapport explicatif Michez et al., 2013), était intégralement basée sur la proposition de typologie du REBENT (Guillaumont et al., 2008 et Bajjouk et al., 2011) à laquelle des habitats identifiés dans la bibliographie ou émanant de la communauté scientifique avaient été intégrés ainsi que certains habitats de la classification EUNIS (2008). Elle contenait 458 unités réparties en 7 niveaux. Suite à l’acquisition de nouvelles informations sur les habitats marins benthiques, une mise à jour de la typologie était nécessaire pour qu’elle soit le reflet des connaissances actuelles et a abouti à une deuxième version parue en 2015 (rapport explicatif Michez et al., 2015). Elle incluait 565 unités réparties en 6 niveaux. La version actuelle, la version 3, est parue en 2019 (rapport explicatif Michez et al., 2019). Elle comporte 664 unités hiérarchisées selon 5 niveaux. Par rapport à la version 2, le premier niveau hiérarchique a entièrement été modifié par soucis de cohérence avec la mise à jour d’EUNIS. Il se compose de 28 unités qui sont des combinaisons d’un étage et d’un type de substrat (par exemple les roches infralittorales). De nouveaux habitats ont été ajoutés, la codification a été totalement revisitée et la terminologie a été homogénéisée.
La collaboration de nombreux experts benthologues a été primordiale pour l'établissement et la consolidation de ce référentiel.
Origine du jeu de données
Fichier créé par Noëmie Michez et mis à jour par Marie La Rivière, Juliette Delavenne et Salomé Andres (PatriNat)
Références bibliographiques
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Référencement
PatriNat, 2023. Table de la typologie nationale des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l'Atlantique (NatHab-Atl). Base de données HabRef v7.
Dernière modification
Depuis la version 5.0 d'HABREF (novembre 2019), modifications de la version 3 de la typologie incluses dans la version 7.0 d'HABREF : 108 fiches descriptives complètes ont été ajoutées pour toutes les unités de niveau 2 et certains champs descriptifs ont été remplis pour 320 fiches de niveau 3 ou 4. Le libellé de 10 unités a été modifié (5 pour tenir compte de l'évolution de la taxonomie et 5 pour clarifier le cadre de l'unité). Une unité de niveau 3 a été supprimée et les 2 unités de niveau 4 qu'elle incluait ont été déplacées. Le statut de présence en France de 22 unités a été modifié en incertain (à confirmer).
Version 3 de la typologie incluse dans la version 5.0 d’HABREF, pour plus d’explications sur les modifications opérées dans cette version de la typologie se reporter au rapport : Michez N., Thiébaut E., Dubois S., Le Gall L., Dauvin J.C., Andersen A. C., Baffreau A., Bajjouk T., Blanchet H., de Bettignies T., de Casamajor M.-N., Derrien-Courtel S., Houbin C., Janson A.L., La Rivière M., Lévèque L., Menot L., Sauriau P.G., Simon N., Viard F., 2019. Typologie des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Version 3. UMS PatriNat, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, 52 p.
Source de l'ajout à la typologie
L’habitat A6-3 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable de la slikke a été ajouté dans la première version de la typologie (Michez et al., 2013) sous la codification et l’intitulé M05.03 Vases intertidales estuariennes de la slikke. Le code et l’intitulé ont ensuite été modifiés dans la Version 3 (Michez et al., 2019).
A6-3 comprend deux sous-habitats de niveau 3, dont l’habitat ajouté dans la version 3, A6-3.2 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable avec couverture végétale. Ce dernier comprend deux sous-habitats de niveau 4 :
- A6-3.2.1 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable avec végétation éparse de salicorne et de spartine qui comprend deux sous-habitats de niveau 5 ajoutés dans la version 3 (A6-3.2.1.1 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable à salicorne et A6-3.2.1.2 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable à spartine).
- A6-3.2.2 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable avec macroalgues opportunistes (anciennement M05.03.02) comprenant un nouveau sous-habitat de niveau 5 (A6-3.2.2.1 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable à Vaucheria en tapis).
Trois sous-habitats ont été ajoutés à l’habitat de niveau 4, A6-3.1.1 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable dominées par les polychètes/bivalves (anciennement M05.03.01.01) :
- A6-3.1.1.3 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable à Limecola balthica
- A6-3.1.1.4 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable à Hediste diversicolor, Limecola balthica et Corophium volutator
- A6-3.1.1.5 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable à Hediste diversicolor, Limecola balthica et Polydora ciliata
Un sous-habitat a été ajouté à l’habitat de niveau 4, A6-3.1.2 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable dominées par les polychètes/oligochètes (anciennement M05.03.01.02) : A6-3.1.2.4 Vases médiolittorales en milieu à salinité variable à Carcinus maenas.
Facteurs abiotiques
Etage : Médiolittoral
Nature du substrat : Vases et vases sableuses
Répartition bathymétrique : >0 m
Hydrodynamisme : Faible à modéré [courants linéaires pouvant être violents lors des crues]
Salinité : Euryhalin
Température : Cyclotherme jounalier [Les températures sont extrêmement variables dans la journée en fonction des différences de température entre l’air et l’eau. En période ensoleillée, la vase chauffe rapidement en surface à marée basse]
Lumière : Système phytal, eaux turbides
Régime trophique : Mésotrophe à eutrophisé
Caractéristiques stationnelles
Vasières des rivages calmes et protégés, où les particules fines peuvent s’accumuler, retrouvées dans les estuaires ainsi que dans les baies et les lagunes sous influence d’eaux douces. Les sédiments sont limono-argileux (vases pures) à limono-sableux (vases sableuses). Les vases pures contiennent plus de 75% de particules fines inférieures à 63 µm (ratio sable:vase < 1:9) et les vases sableuses correspondent à un ratio sable:vase compris entre 1:9 et 1:1. Dans les estuaires, les particules de limon et d’argile proviennent du bouchon vaseux et sédimentent sur l’estran lors du jusant par phénomène d’accrétion ou de colmatage. Plus la teneur du substrat en particules fines est importante, plus il est cohésif et devient rapidement anoxique depuis sa surface. La slikke est caractérisée par une première zone de vasière nue, qui connaît de courtes périodes de dessiccation, surmontée par une zone plus régulièrement exondée et qui peut être colonisée, dans sa partie supérieure, par une végétation pionnière, caractérisée par les spartines et les salicornes. Cet habitat présente une forte productivité primaire et secondaire. Le microphytobenthos qui se développe à la surface du sédiment à marée basse est consommé par divers phylum. L’endofaune est caractérisée par une communauté macrobenthique constituée de polychètes, de bivalves et d’oligochètes, et d’une méiofaune dominée par les nématodes. L’habitat vasière correspond au substrat meuble présentant la plus importante densité faunistique. Au sein des estuaires, la diversité spécifique diminue à mesure que l’on remonte vers l’amont, en suivant l’abaissement de la salinité et l’augmentation de la turbidité, tandis que la densité d’individus augmente.
Variabilité
L’habitat varie selon la combinaison des facteurs suivants :
- le régime tidal, qui selon la zone géographique est mésotidal, macrotidal ou mégatidal ;
- l’hydrodynamisme local, corrélé à la morphologie du site et au positionnement au sein du système estuarien ;
- le gradient de salinité, qui dépend de la marée et du débit du fleuve ;
- la composition du substrat, sa teneur en matière organique selon les apports fluviaux ;
- l’intensité de la production primaire ;
- la topographie, avec un profil de pente plus ou moins élevé ;
- la pollution et autres pressions anthropiques.
Variabilité selon la présence ou non de phanérogames (salicornes, spartines, zostères), la localisation par rapport à la mer. De manière générale, la composition floristique et faunistique diminue en diversité de l’embouchure vers l’amont du fleuve. Les sous-habitats de niveau trois sont décrits sur leur page INPN respective.
Communautés ou espèces caractéristiques
L’habitat médiolittoral A6-3 ne se reconnait pas par des espèces caractéristiques mais par le type de substrat en milieu à salinité variable.
Espèces associées
La liste fournie ne constitue pas une liste exhaustive des espèces associées à cet habitat. La liste suivante regroupe les espèces communément retrouvées dans les secteurs polyhalin, mésohalin et oligohalin de cet habitat. Pour le secteur euhalin, se référer à la liste d’espèces associées de l’habitat A6-1 Vases médiolittorales marines, à laquelle peuvent être ajoutées les espèces citées ici. Des espèces inféodées à d’autres habitats, associés ou en contact, peuvent être retrouvées dans les vases médiolittorales, transportés par les flots.
En domaines oligohalin et mésohalin, le type sédimentaire joue un rôle secondaire dans la structuration des peuplements benthiques. On pourra ainsi trouver dans ces secteurs les mêmes espèces quel que soit le type de substrat meuble.
Dynamique temporelle
La slikke couverte de plantes halophiles évolue au fil des saisons avec une production primaire maximale au printemps et un optimum de biomasse à la fin de l’été/début d’automne.
Les macroalgues opportunistes (Vaucheria, Ulva spp.), ainsi que le microphytobenthos, montrent des pics de production primaire et de biomasse au printemps et en été. Si l’augmentation des températures estivales est associée à des apports excessifs de nutriments, des phénomènes d’eutrophisation, avec prolifération massive de macroalgues opportunistes, peuvent avoir lieu.
La densité totale des espèces de la macrofaune et de la méiofaune est bien supérieure en été qu’en saison hivernale. La saison estivale, synonyme d’un régime hydraulique et de gradient de salinité plus constants, favorise le recrutement d’espèces. En période hivernale, le fort débit fluvial, qui modifie la salinité et la cohésion des sédiments, impacte les communautés établies lors de la saison précédente.
Habitats pouvant être associés ou en contact
Possibilité de contact supérieur avec l’habitat du supralittoral :
- A6-2 Vases supralittorales en milieu à salinité variable du schorre
Possibilité de contact ou d’association avec :
- A1-5 Roches ou blocs médiolittoraux avec fucales en milieu à salinité variable
- A3-3 Sédiments grossiers médiolittoraux en milieu à salinité variable
- A4-2 Sédiments hétérogènes envasés médiolittoraux en milieu à salinité variable
- A5-5 Sables médiolittoraux en milieu à salinité variable
- A5-6.2 Herbiers à Zostera noltei sur sables médiolittoraux en milieu à salinité variable
- A6-4.2 Herbiers à Zostera noltei sur vases médiolittorales en milieu à salinité variable
Possibilité de contact inférieur avec les habitats infralittoraux :
- B1-8 Roches ou blocs infralittoraux en milieu à salinité variable
- B3-3 Sables grossiers et graviers infralittoraux en milieu à salinité variable
- B4-2 Sédiments hétérogènes infralittoraux en milieu à salinité variable
- B5-4 Sables mobiles infralittoraux en milieu à salinité variable
- B5-5 Herbiers à Zostera marina sur sables infralittoraux
- B5-6 Herbiers à Ruppia maritima sur sables infralittoraux
- B6-4 Vases infralittorales en milieu à salinité variable
Confusions possibles
Confusion possible avec les habitats A4-2 Sédiments hétérogènes envasés médiolittoraux en milieu à salinité variable et A5-5 Sables médiolittoraux en milieu à salinité variable selon l’appréciation de la granulométrie du sédiment sur le terrain. Ces habitats peuvent de plus accueillir une faune et une flore similaires, voire identiques, en domaines mésohalin et oligohalin. Des analyses sédimentaires complètes en laboratoire permettraient de distinguer si nécessaire ces différents habitats.
Une confusion d'ordre altitudinal peut également avoir lieu avec les habitats B6-4 Vases infralittorales en milieu à salinité variable et A6-2 Vases supralittorales en milieu à salinité variable du schorre. La limite entre la haute slikke et le bas schorre peut être difficilement perceptible du fait du remplacement progressif et du chevauchement des cortèges floristiques associés. Les prairies à spartines ou à salicorniaies pionnières annuelles de la slikke peuvent par exemple déborder sur le bas schorre. Les relevés des coordonnées GPS couplés aux cartes topographiques et marines permettent de faire la distinction.
Pour ces mêmes facteurs altimétrique et granulométrique, les habitats A4-2 Sédiments hétérogènes envasés médiolittoraux en milieu à salinité variable et A5-5 Sables médiolittoraux en milieu à salinité variable peuvent également porter à confusion.
Répartition géographique
Cet habitat est présent dans la majorité des estuaires de la façade Manche – Mer du Nord – Atlantique et des abers de Bretagne ainsi que dans les baies et les lagunes sous influence d’eaux douces.
Fonctions écologiques
La vasière constitue une zone de nourrissage essentielle pour un grand nombre d’herbivores et de carnivores, sédentaires ou en migration. Le microphytobenthos qui se forme en surface est consommé à marée basse par les hydrobies et les scrobiculaires, puis à marée haute par les poissons brouteurs tels que les mulets et des invertébrés benthiques. La faune benthique est à la base de l’alimentation des oiseaux limicoles dans la partie marine des estuaires (gravelots, bécasseaux, barge rousse, chevalier gambette …) et de poissons benthiques (soles, plies et flets) ou démersaux (bars, tacauds et éperlans). Les vasières sont également fréquentées par les poissons amphihalins migrateurs (truite de mer, saumon, anguille, lamproie fluviale, lamproie maritime, alose franche ou éperlan) et constituent un site d’hivernage pour de nombreuses espèces d’oiseaux.
La végétation de la haute slikke contribue à la fixation des sédiments fins et stabilise les rivages. Elle confère également une zone de refuge pour les poissons juvéniles à marée haute.
Statut de conservation
Au titre de la DHFF (92/43/CEE), cet habitat est inclus dans l’Habitat d’Intérêt Communautaire (HIC) 1140 « Replats boueux ou sableux exondés à marée basse ». Il peut également correspondre à l’HIC 8330 « Grottes marines submergées ou semi-submergées » sous réserve de respect des critères d'identification de l'HIC (notamment de structure) et à l’HIC 1130 « Estuaires » ou l’HIC 1150 « Lagunes côtières » sous réserve de respect des critères d'identification géomorphologiques et de délimitation physiographiques de l'HIC. De la même façon, cet habitat peut correspondre aux vasières estuariennes qui sont listés par la Convention OSPAR en tant qu’habitats menacé et/ou en déclin.
Tendance évolutive
Le phénomène de sédimentation accentué par la végétation à Spartinaies a tendance à favoriser la concurrence de la spartine envahissante Spartina anglica sur d’autres habitats.
Cet habitat est vulnérable face à l’urbanisation des rivages (polder, endiguements, aquaculture, pâturage trop intensif…) qui modifie le phénomène de sédimentation ou le détruit directement.
Auteur(s)
Latry L., Blanchet H.
Date de rédaction
2020
Bibliographie
Michez N., Aish A., Hily C., Sauriau P.-G., Derrien-Courtel S., de Casamajor M.-N., Foveau A., Ruellet T., Lozach S., Soulier L., Popovsky J., Blanchet H., Cajeri P., Bajjouk T., Guillaumont B., Grall J., Gentil F., Houbin C., Thiébaut E., 2013. Typologie des habitats marins benthiques français de Manche, de Mer du Nord et d'Atlantique : Version 1. Rapport SPN 2013 - 9, MNHN, Paris, 32 p. (Source)
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