Typologie nationale des biocénoses benthiques de Méditerranée (NatHab-Med)
Date de mise à jour du jeu de données
08/11/2021
Auteurs de la typologie
Noëmie MICHEZ (PatriNat), Annabelle AISH (PatriNat), Jean-Michel Amouroux, Gérard BELLAN (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Denise BELLAN-SANTINI (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Pierre CHEVALDONNE (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Guillaume DIRBERG (SPN, MNHN), Marie-Claire FABRI (IFREMER, LER), Thierry FERNEZ (Office de l’Environnement de la Corse), Maïa FOURT (GIS Posidonie), Patrice FRANCOUR (Université de Nice-Sophia Antipolis, EA 4228 ECOMERS), Guy-François FRISONI (Office de l’Environnement de la Corse), Adrien GOUJARD (GIS Posidonie), Jean-Georges HARMELIN (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294), Esther JORDANA (Centre d'Estudis Avançats de Blanes), Mario KLESCZEWSKI (Conservatoire d'Espaces Naturels, Languedoc-Roussillon), Céline LABRUNE (Observatoire Océanologique de Banyuls sur Mer, FRE 3350 LECOB), Jean-Baptiste MOURONVAL (Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage), Laura PALOMBA (SPN, MNHN), Thierry PEREZ (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Gérard PERGENT (Université de Corse Pasquale Paoli, UMR 6134 SPE), Christine PERGENT-MARTINI (Université de Corse Pasquale Paoli, UMR 6134 SPE), Stéphane SARTORETTO (IFREMER, LER), Thierry THIBAUT (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294), Jean VACELET (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Marc VERLAQUE (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294)
Auteurs de la table
Marie LA RIVIERE, Noëmie MICHEZ (PatriNat, OFB-CNRS-MNHN)
Territoire(s) concerné(s)
Méditerranée française
Organisme responsable
PatriNat, OFB-CNRS-MNHN, anciennement SPN
Langue d'origine des données
FR
Contexte
Compte tenu de l’intérêt grandissant des politiques publiques pour le milieu marin et de l’actualité chargée des différents programmes de gestion, de conservation ou d’inventaire (inventaires ZNIEFF, inventaire biologique et analyse écologique des habitats marins patrimoniaux, Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin, Système d’Information sur la Nature et le Paysage), le besoin de cohérence est élevé. Le développement de ces programmes nécessite la mise en place et l’utilisation d’outils tels que les référentiels. Ils permettent de définir un langage commun ainsi que les unités de travail. Parmi ces référentiels, il existe plusieurs classifications des habitats benthiques. Créées dans des contextes particuliers, elles répondent à des objectifs donnés, soit de connaissance et d’inventaire comme la typologie des ZNIEFF-Mer (Dauvin et al., 1994), soit de gestion et de conservation comme la typologie des habitats d’intérêt communautaire de l’Union Européenne (European Commission, 2007). Ces outils, adaptés à leur problématique, se rapportent à des échelles différentes : européenne pour Natura 2000 et EUNIS, nationale ou régionale pour les ZNIEFF. Il a donc paru nécessaire d’homogénéiser et d’harmoniser les référentiels existants.
Description du travail
Ce travail a abouti à la création d’une liste de référence française des biocénoses, faciès et associations présents en Méditerranée. Elle a été élaborée en synthétisant et en actualisant les typologies existantes se rapportant aux habitats benthiques méditerranéens : la déclinaison française des habitats d’intérêt communautaire élaborée dans le cadre de Natura 2000 (Glémarec et Bellan-Santini in Bensettiti (coord.) et al., 2004), la classification des biocénoses benthiques marines de la région méditerranéenne élaborée dans le cadre de la Convention de Barcelone (PNUE, PAM, CAR/ASP, 2006 et 2007) ainsi que la liste des biocénoses de Méditerranée de l’inventaire ZNIEFF en PACA (Bellan-Santini et al., 2003). Ces classifications biocénotiques s’inscrivent dans la lignée des travaux de Pérès et Picard sur la définition des biocénoses benthiques de Méditerranée (Pérès et Picard, 1964). La typologie présentée dans ce travail ne comporte pas de changements majeurs. Les biocénoses décrites dans la littérature y ont été reportées et les principales modifications interviennent au niveau des faciès et des associations. Certains ont été supprimés, d’autres ont été ajoutés. Ils ont, pour la plupart, été conservés et peuvent avoir été regroupés, dissociés ou leur libellé a été modifié. Cette typologie est structurée en quatre niveaux. Le premier niveau correspond à l’étagement et le deuxième aux substrats et/ou le régime de salinité. Le troisième niveau fait apparaitre les biocénoses, le niveau quatre les faciès et associations de ces biocénoses. L’échelle de description de l’habitat (identifié par sa biocénose) correspond à l’échelle des habitats occupés par les macrophytes et la macrofaune benthiques. Les faciès et associations peuvent présenter un caractère saisonnier ou géographiquement localisé et ne constituent pas un niveau distinct mais un aspect particulier de la biocénose. Cette typologie de référence nationale peut être utilisée pour l’ensemble des programmes et outils qui concernent la façade méditerranéenne. Le niveau 3, celui de la biocénose, est généralement adapté aux problématiques de gestion et de conservation en permettant de nommer les habitats, notamment dans le cadre de travaux cartographiques. Le niveau des associations et des faciès est plus difficilement cartographiable à une certaine échelle (car nécessitant a priori des efforts d’échantillonnage élevés), mais reste néanmoins important pour la connaissance et leur prise en compte dans les études et inventaires. La première version de la typologie a été établie en 2011. Elle a été mise à jour en 2014 suite à de nouvelles acquisitions de connaissances. Un rapport détaillant les modifications effectuées entre ces deux versions (Michez et al., 2014) est disponible sur le site de l'INPN : http://spn.mnhn.fr/spn_rapports/archivage_rapports/2014/SPN%202014%20-%2033%20-%20Typologie_Mediterranee_version_2.pdf.
La description de chaque unité de niveaux 3 et 4 de cette typologie a été réalisée entre 2016 et 2021 (La Rivière et al., 2021). Au total le référentiel comporte 151 fiches descriptives pour les biocénoses, faciès et associations de la typologie (seul un faciès n'a pas été décrit). Les fiches descriptives se basent sur les descriptions d’habitats d’autres typologies lorsqu’elles sont disponibles et ont été complétées ou entièrement rédigées avec l’aide des experts benthologues.
Lors de cet exercice, 5 unités ont été supprimées de la typologie par manque de preuve de leur existence et 2 unités ont changé de statut de présence en France métropolitaine passant de "Présent" à "A confirmer".
Origine du jeu de données
Fichier créé par Noëmie MICHEZ (PatriNat) et mis à jour par Marie LA RIVIERE (PatriNat).
Références bibliographiques
La Rivière M., Michez N., Delavenne J., Andres S., Fréjefond C., Janson A-L., Abadie A., Amouroux J-M., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Cimiterra N., Derolez V., Fernez T., Fourt M., Frisoni G-F., Grillas P., Harmelin J-G., Jordana E., Klesczewski M., Labrune C., Mouronval J-B., Ouisse V., Palomba L., Pasqualini V., Pelaprat C., Pérez T., Pergent G., Pergent-Martini C., Sartoretto S., Thibaut T., Vacelet J., Verlaque M., 2021. Fiches descriptives des biocénoses benthiques de Méditerranée. UMS PatriNat éd., Paris : 660 pp.
Michez N., Fourt M., Aish A., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Fabri M.-C., Goujard A., Harmelin J.-G., Labrune C., Pergent G., Sartoretto S., Vacelet J., Verlaque M., 2014. Typologie des biocénoses benthiques de Méditerranée Version 2. Rapport SPN 2014 - 33, MNHN, Paris, 26 pp.
Référencement
PatriNat, 2021. Table de la typologie nationale des biocénoses benthiques de Méditerranée (NatHab-Med). UMS PatriNat / INPN, novembre 2021.
Dernière modification
Depuis la version 6.0 d'HABREF (décembre 2021) : modification du libellé de la typologie (NatHab-Med)
Depuis la version 5.0 d'HABREF (novembre 2019), 37 fiches descriptives ont été ajoutées et certaines fiches préalablement diffusées ont été complétées ou modifiées. Le libellé de 19 unités a été modifié (15 pour tenir compte de l'évolution de la taxonomie et 4 clarifier le cadre de l'unité). Une unité a été supprimée faute de preuves de son existence.
Depuis la version 4.0 d'HABREF (octobre 2017), 8 fiches descriptives ont été ajoutées concernant les biocénoses des substrats meubles supralittoraux, infralittoraux, circalittoraux et du bathyal.
Depuis la version 3.1 d'HABREF (janvier 2017), 13 fiches descriptives ont été ajoutées concernant les biocénoses des substrats meubles infralittoraux, le coralligène et leurs faciès.
Facteurs abiotiques
Etage : Infralittoral
Nature du substrat : Meubles (sables grossiers à envasés), durs (roche en place, éboulis)
Répartition bathymétrique : 0,5 m à 40 m
Situation : Mer ouverte
Hydrodynamisme : Variable
Salinité : Normale (minimum 36) à hyperhaline (43)
Température : 9 à 29°C
Lumière : Variable
Caractéristiques stationnelles
Cette association se caractérise par de la matte morte de Posidonia oceanica sans macro‐épiflore (Bajjouk et al., 2015)
On nomme "matte" l’ensemble constitué par les rhizomes, les écailles (anciennes bases foliaires persistantes), les racines et par le sédiment qui remplit les interstices. Les rhizomes, les écailles et les racines sont peu putrescibles et se conservent donc, à l’intérieur de la "matte", pendant plusieurs siècles ou millénaires (Boudouresque et al., 1980 ; Mateo et al., 2006 ; Monnier et al., 2019) qui reste en place même après la mort de l’herbier.
Cette structure n’est pas colonisée de façon significative par des macrophytes (macro-épiflore) et les rhizomes morts sont nettement visibles en surface. Elle se présente sous forme de larges étendues témoignant de l’extension passée d’un herbier à Posidonia oceanica ou plus ponctuellement au sein d’un herbier vivant (Boudouresque et al., 2019).
Variabilité
Cette association s’étend généralement sur des surfaces sub-horizontales, au sein d’un herbier à Posidonia oceanica ou en périphérie (ex au-delà de la limite inférieure). En fonction de l’hydrodynamisme et de la dynamique de l’herbier, elle peut quelques fois présenter des structures irrégulières (buttes) ou être entaillée par des petites falaises (tombants de matte) résultant de l’érosion du substrat.
De façon générale elle recouvre des fonds meubles et peut atteindre plusieurs mètres d’épaisseur mais elle peut aussi être observée en placage sur roche.
Dynamique
Cette association peut résulter de la dynamique naturelle de l’herbier (phases d’accrétion et de colonisation ; Molinier & Picard, 1952 ; Boudouresque et al. 2006), de l’élévation du niveau de la mer (recul des herbiers profonds ; Pergent et al., 2015) mais résulte le plus souvent de l’impact de l’homme (ancrage, chalutage, aménagements littoraux, augmentation de la turbidité ; Boudouresque et al. 2006). Outre la disparition de l’herbier vivant, les impacts anthropiques mécaniques conduisent à l’ouverture de sillons dans la matte qui peuvent s’élargir au cours du temps (Alami et al., 2014).
Si les conditions de milieu s’améliorent (ex. arrêt des impacts anthropiques) cette association peut évoluer à nouveau vers la biocénose de l’herbier à Posidonia oceanica (à partir de boutures ou de recolonisation en périphérie).
Espèces caractéristiques
Posidonia oceanica (Linnaeus) Delile (Espèce structurante)
Espèces associées
Les espèces associées sont les mêmes que celles de la biocénose de l’herbier à Posidonia oceanica pour la partie endogée (gastéropodes, annélides polychètes, crustacés ; Willsie, 1987) et un nombre plus réduit d’espèces pour la partie épigée (Pinna nobilis [1] était une espèce souvent associée mais victime d’une épizootie depuis quelques années, ses populations ont fortement régressées). L’association peut être ponctuellement colonisée par des espèces invasives (ex. Caulerpa cylindracea, Caulerpa taxifolia). On trouve également les espèces Octopus vulgaris Cuvier, 1797 et Echinaster sepositus (Retzius, 1783)
Pinna nobilis Linnaeus, 1758 (La grande nacre) est une espèce patrimoniale et protégée :
Directive 92/43/CEE (Directive européenne dite Directive Habitats-Faune-Flore) : Annexe IV
Amendement protocole Barcelone : Annexe II
Liste des animaux de la faune marine protégés sur l’ensemble du territoire français métropolitain : Article 1
Espèce déterminante de l'inventaire ZNIEFF Corse, Languedoc-Roussillon et PACA,
Principaux critères de reconnaissance
Structure bioconstruite par la magniolophyte marine Posidonia oceanica, avec la présence de rhizomes et de racines en surface et l’absence d’une couverture par de grandes macrophytes.
Habitats associés ou en contact
Herbier à Posidonia oceanica vivant, substrats meubles (biocénose des sables fins bien calibrés ; biocénose des sables grossiers et fins graviers sous influence des courants de fond) ou l’association de la matte morte de Posidonia oceanica à Caulerpa prolifera, Cymodocea nodosa, Penicillus capitatus.
Confusions possibles
Peu de confusion possible sauf avec éventuellement l’association de la matte morte de Posidonia oceanica à Caulerpa prolifera, Cymodocea nodosa, Penicillus capitatus en fonction du niveau de couLa même que celle de la biocénose de l’herbier à Posidonia oceanica (côtes méditerranéennes), entre 0,5 et 40 m de profondeur.verture par ces macrophytes.
Répartition géographique
La même que celle de la biocénose de l’herbier à Posidonia oceanica (côtes méditerranéennes), entre 0,5 et 40 m de profondeur.
Structure et fonctions
Il s’agit d’une structure bioconstruite d’épaisseur variable (quelques centimètres à plusieurs mètres), constituée d’une partie organique significative (rhizomes, écailles racines) colmatée par du sédiment, de granulométrie variable, et qui forme l’équivalent d’un substrat intermédiaire entre les substrats durs et les substrats meubles.
Intérêt pour la conservation
Cette association est à l’origine du développement de nombreuses espèces endogées source d’une biodiversité importante et de ressources trophiques, notamment pour l’ichtyofaune.
La matte constitue également un stock de carbone particulièrement important, comparable aux tourbières en milieu terrestre, et sa conservation revêt dont un intérêt particulier dans le contexte du changement climatique.
Menaces potentielles
Destructions mécaniques par l’ancrage, notamment les grosses unités de plaisance et par le chalutage qui ouvrent de véritables tranchées dans la matte et facilitent le recyclage du carbone piégé. Le recouvrement partiel par le dépôt de rejets de dragage (clapage) est également observé à proximité d’infrastructures portuaires.
Tendance évolutive
En dehors des impacts anthropiques mécaniques, cette association est de nature à évoluer naturellement vers un herbier à Posidonia oceanica si les conditions de l’environnement sont favorables (dynamique de l’herbier).
Auteur(s)
Pergent G., Pergent-Martini C., Fréjefond C.
Date de rédaction
2021
Bibliographie
La Rivière M., Michez N., Delavenne J., Andres S., Fréjefond C., Janson A-L., Abadie A., Amouroux J-M., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Cimiterra N., Derolez V., Fernez T., Fourt M., Frisoni G-F., Grillas P., Harmelin J-G., Jordana E., Klesczewski M., Labrune C., Mouronval J-B., Ouisse V., Palomba L., Pasqualini V., Pelaprat C., Pérez T., Pergent G., Pergent-Martini C., Sartoretto S., Thibaut T., Vacelet J., Verlaque M., 2021. Fiches descriptives des biocénoses benthiques de Méditerranée. UMS PatriNat éd., Paris : 660 pp. (Source)
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Michez N., Fourt M., Aish A., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Fabri M.-C., Goujard A., Harmelin J.-G., Labrune C., Pergent G., Sartoretto S., Vacelet J., Verlaque M. 2014. Typologie des biocénoses benthiques de Méditerranée Version 2.Rapport SPN 2014 - 33, MNHN, Paris, 26 pp. (Source)
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