Les habitats présents au sein de la ZNIEFF sont essentiellement des habitats prairiaux qui s'inscrivent dans un contexte bocager, avec la présence de haies et d'arbres têtards. Leur diversité est importante, et s'exprime principalement en raison du gradient hydrologique, des particularités topographiques et des pratiques agricoles. Parmi les 10 habitats identifiés sur la partie centrale de cette vaste prairie (DSNE, 2008) et son réseau hydraulique, 8 ont un intérêt patrimonial et 4 se distinguent par leur intérêt au niveau européen :
- la végétation aquatique enracinée flottante installée sur le tiers amont de la vieille Sèvre, et sur la principale dépression temporaire au nord de la prairie.
- la végétation aquatique libre, uniquement sur le tiers amont de la vieille Sèvre.
- les eaux eutrophes libres de végétation présentes sur les deux tiers aval de la vieille Sèvre, après la confluence avec les petits ruisseaux du Lavaud, où le lit devient plus profond et large
- l’ourlet riverain (mégaphorbiaie eutrophe) présent sur le tiers amont de la vieille Sèvre.