Au total, neuf habitats déterminants de ZNIEFF ont été recensés sur ces coteaux et au sein des boisements.
Le Bois de Course et le Bois du Miroir présentent deux habitats forestiers déterminants de ZNIEFF relevant du Carpinion betuli (inscrits également à l’annexe 1 de la Directive européenne Habitats-Faune-Flore) : la Hêtraie à Mercuriale vivace (Mercuriali perennis - Aceretum campestris), bois caractéristique des pentes des coteaux crayeux et la Hêtraie atlantique acidicline à Jacinthe des bois (Endymio non scriptae - Fagetum sylvaticae), observée sur les sols souvent décalcifiés de la partie supérieure du coteau ou en haut de plateau, développés sur colluvions limoneuses ou limons, ces derniers parfois avec des silex.
Un habitat forestier déterminant n’a pas été observé depuis 2010, il s’agit de l’Adoxo moschatellinae - Fraxinetum excelsioris allietosum ursini. Appartenant au Fraxino excelsioris - Quercion roboris et observé au Bois du Miroir, cette sous-association des bas de pentes de coteaux crayeux présente un tapis herbacé caractéristique d’Ail des ours.
Parmi les milieux ouverts, la pelouse mésohygrophile à Succise des prés (Succiso pratensis - Brachypodietum pinnati) a pu être identifiée sur le coteau du Fond de Crandal. Inscrite à l’annexe 1 de la Directive européenne « Habitats-Faune-Flore », elle est considérée comme rare à l’échelle régionale. Cette association vulnérable est menacée à la fois par l’eutrophisation (apport de fertilisants et d’amendements, intensification du pâturage provoquant l’évolution de la pelouse en prairie) et par l’embroussaillement et la colonisation par les ligneux, avec développement de fourrés lié à l’abandon des pratiques pastorales. Les coteaux visités témoignent de la vulnérabilité de cet habitat.
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