L’intérêt principal du Mont d’Éclemy réside dans le maintien de végétations herbacées calcicoles à la flore encore diversifiée et relevant de plusieurs communautés déterminantes de ZNIEFF comme la pelouse du Succiso pratensis - Brachypodietum pinnati, la prairie de fauche à rattacher au Trifolio montani - Arrrhenatherenion elatioris, l'ourlet calcicole du Bunio bulbocastani - Brachypodietum pinnati, et peut-être d’autres associations plus rares qui sont à confirmer, notamment l’ourlet suffrutescent du Lathyro sylvestris - Astragaletum glycyphylli, non revu récemment. Ces végétations ont tendance à régresser et à être remplacées par un Fourré à Ronce à feuilles d'orme et Genévrier commun (Rubo ulmifolii - Juniperetum communis). Vers le Mont de Sanghen, ces pelouses laissent progressivement la place à la Hêtraie - Frênaie du Mercuriali perennis - Aceretum campestris et à la Forêt de Hêtre commun et Jacinthe des bois (Endymio non-scriptae - Fagetum sylvaticae). Malgré l’intérêt de ces boisements, il est ici capital de limiter leur extension au profit de la mosaïque des végétations herbacées calcicoles les plus rares et les plus menacées.
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