Outre les habitats déterminants accueillant des espèces végétales déterminantes (prairies humides et boisement alluviaux essentiellement) qui représentent la plus grosse partie des enjeux habitats naturels du site, présence très ponctuelle d'habitats déterminants en mauvais état de conservation : gazon amphibie à Baldellie fausse-renoncule (Baldellia ranunculoides), herbier enraciné des plans d'eau eutrophe à Potamot nageant (Potamogeton natans). Ces habitats ont subi d'importantes perturbations, notamment par la mise en culture importante du marais.